Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM9Q9NXL9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM9Q9NXL9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms