Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF38Q9NXL2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms