Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM28Q9NW13 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM28Q9NW13 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms