Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVG8

TBC1D13, TBC1 domain family member 13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D13Q9NVG8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBC1D13Q9NVG8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBC1D13Q9NVG8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms