Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO28Q9NVF7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO28Q9NVF7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms