Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINM1Q9NU53 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINM1Q9NU53 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms