Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms