Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC1Q9NTX5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC1Q9NTX5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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