Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RRP7BPQ9NSQ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RRP7BPQ9NSQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms