Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms