Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOMER3Q9NSC5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms