Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SALL1Q9NSC2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL1Q9NSC2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms