Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms