Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM5Q9NQX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM5Q9NQX1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms