Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FZD3Q9NPG1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms