Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP2Q9NPB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP2Q9NPB3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms