Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms