Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms