Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC4Q9H6D8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms