Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD4Q9H223 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms