Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDT1Q9H211 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDT1Q9H211 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms