Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIL1Q9H173 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms