Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM39BQ9GZU3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM39BQ9GZU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms