Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRCC1Q9C099 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms