Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INO80BQ9C086 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms