Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms