Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTPBP4Q9BZE4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTPBP4Q9BZE4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms