Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHANK3Q9BYB0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHANK3Q9BYB0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms