Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDCA4Q9BXL8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDCA4Q9BXL8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms