Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms