Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HIRIP3Q9BW71 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms