Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms