Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGACTQ9BVM4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms