Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2AFJQ9BTM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms