Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCMBPQ9BTE3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms