Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms