Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms