Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MESP1Q9BRJ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms