Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms