Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF559Q9BR84 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms