Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms