Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms