Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID3AQ99856 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms