Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYD88Q99836 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms