Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5SQ99766 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5SQ99766 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms