Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP8Q99708 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms