Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3R4Q99570 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3R4Q99570 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms