Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KC1Q96S38 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms