Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PHF12Q96QT6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms