Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms